本部之課程內涵，包括由戰術組所教授之航海、船藝、兵器系統工程、戰鬥系統與運用、地圖閱讀、兩棲作戰、情報基本概念、領導統御、國軍新一代兵力簡介、偵蒐系統概論、航海英文、戰術運動、兵器概論、指管通情 、海事法規、海軍戰略與戰術、資訊戰基本概念、陸海空簡介、防空概論、海軍概論、海軍值更勤務、通報話規程、密譯法、通信現行作業程序等軍事課程。由輪機組則教授海軍輪機概論、輔機、內燃機、汽機與鍋爐、燃氣渦輪機、輪機模擬系統、艦內通信、輪機管理、電羅經、消磁、核生化、輪機實務與安全等艦艇輪機課程，以及由體育組所教授之體育課程。經由本部課程學習與艦艇實習之學程規劃與輔導，學生必須面對挑戰、全力以赴，才能完成理論與實務經驗結合之軍事學科教育，成為海軍精英中之一員。